Ich empfehle dir eine Server Mod, am besten tMod.
Das praktische ist, dass der Server dann in einem extra Fenster läuft und nicht alle raus geschmissen werden wenn du den Server verlässt. Es gibt den Befehl save, damit kannst du manuell speichern, aber wenn du den Server mit exit schließt, wird auch deine Welt gespeichert.
Es gibt auch super Plugins, damit kannst du viele neue Funktionen auf deinen Server bringen.
Gucks dir einfach mal an:

Die aktuelle Version für Terraria 1.0.6 gibts hier: