Also bei Nitrado kannst du ganz bequem auswählen ob du Vanilla oder Bukkit installiert haben willlst.
Wenn du dann dein Server einrichten willst, z.B Plugins hochladen, brauchst du ein zusätzliches Programm mit dem du auf den Server zugreifen kannst.
Ein gutes und kostenloses ist Filezilla:
Dann ist es eig. ähnlich wie bei einem Hamachi Server/ Server auf deinem PC.
Bei Fragen kannst du dich via pm melden, kann euch offene Fragen beantworten