Hab ich doch oben geschrieben, so mache ich es jedenfalls immer. Musst nur darauf achten, dass der Server runtergefahren ist. Weil Mysql ja die ganze Zeit genutzt wird.
Also:
1.) Auf den Root connecten also mit z.B File Zilla
2.) In den Pfad /var/db/mysql gehen
3.) Rauskopieren.