Also wenn du eine Datei ablegen möchtest, machst du das einfach so, wie du jede andere Datei auch Lesen/Schreiben würdest. Dabei solltest du darauf achten, dass du einen geeigneten Speicherort auswählst, damit die Datei nicht so schnell (ausversehen) gelöscht wird.
Oder du nutzt die Java-Preferences-API Näheres dazu in der

. Dies hat den Vorteil, dass keine direkte Datei abgelegt wird und du dir, weder um den Speicherort, noch um das Lesen/Schreiben Gedanken machen musst.