Ich glaube nicht, dass das Spigot Team jetzt gleich wieder aufgeben wird. Bukkit wird es bestimmt noch einige Versionen lang geben. (Es gibt ein vorprogrammiertes Ende, nämlich die veröffentlichung der offiziellen Minecraft-API, aber die wird wohl eher in Version 1.12 kommen, als in 1.9)
Außerdem, was willst du als Alternative nehmen? Es gibt imgrunde nichts was aktuell mit Bukkit mithalten kann, was einem Programmierer natürlich egal sein kann.