Man benutzt dafür meistens das JSONAPI von Bukkit:

es gibt dort genug Beispiele wie man dann über PHP Code Server Commands abschicken kann wie z.B. einem bestimmten User ein Item geben oder die Anzahl der Spieler die online sind zurückzugeben
solltest du kein Entwickler sein kannst du mal nach "minecraft cms" suchen in Google und dir das auswählen was dir am meisten gefällt
besonders auf Elitepvpers gibt eine große Anzahl an Content Management Systems (CMS) die für Minecraft Server optimiert wurden
solltest du es noch einfacher haben wollen versuch es mal bei zap-hosting: