Hatte ein ähnliches Problem.
Wenn ich richtig gelesen habe verstehe ich das so, dass du überall pvp ein hast und die richtigen Permissions gegeben hast.
Hast du schonmal probiert eine Region zu definieren und dort mit /region flag zu arbeiten?
Also auf deutsch mit Worldguard Region makieren /region define PVPArena
/region flag PVPArena pvp allow.
Oder:
Mein Problem war das er auch nicht die geänderten permissions in den Textdatein angenommen hat.
Alles war richtig eingestellt doch die servergruppe konnte es nicht nutzen.
Ich habe dan den server neu gemacht und die Servergrupen über die consolen commands beziehungsweise ingame commands geändert, was dan brächtig funktioniert hatt.
Für multiverse könntest du auch noch das probieren da stehen die permissions und wie man was ingame ändern kann ohne die Textdatein zu verwenden.