Ja kannst du du musst einfach die craftbukkit-[BlaBla]
umbenennen in craftbukkit falls nötig .jar hintendran hängen.
Dann per FTP auf den Nitrado Server und dort in den ordner minecraftbukkit navigieren.
Dort einfach deine umbenannte craftbukkit.jar in den FTP per Drag&Drop reinziehen überschreiben Server neustarten das wars
mfg