Bukkit ist eine Serversoftware die modifiziert ist. Auf Bukkit kann man Plugin's installieren, mehr brauchst du eigentlich nicht drüber zu wissen. Es gibt auch noch den Canary Mod auf den man auch Plugin's installieren kann. Ich persönlich finde aber Bukkit besser.
Plugin's zu installieren ist recht einfach. Du musst einfach nur schauen welches Build du von Bukkit benutzt und kannst dann in der Plugin Liste (

) deine Plugins suchen und runterladen und noch schauen ob sie aktuell sind. Ich hoffe das du etwas Englisch kannst sonst könnte das etwas schwierig werden. Um die Plugins zu installieren brauchst du ein FTP Programm (zum Beispiel Filezilla). Im Webinterface von Nitrado gibts ein Menü das FTP Daten oder so ähnlich heißt. Dort steht dann IP, Benutzer und Passwort was du noch eingeben musst. Dann gehst du in Filezilla oben links auf Datei ~> Servermanager und erstellst dort einen neuen Server. Bei Server gibst du dann die IP ein, Port kannst du leer lassen und bei Servertyp nimmst du FTP. Verbindungsart wählst du normal und bei Benutzer der Name (z.B ni_564686) und bei Passwort halt dein Passwort. Konto und Kommentare kannst du auch leer lassen. Dann siehst du dorte zum Beispiel die Server.properties wo du Einstellungen wie Monster einstellen kannst. Außerdem ist dort noch der World ordner wo deine Welt gespeichert ist. Dort kannst du natürlich auch deine Single Player World rein ziehen. Dann gibt es dort ein Ordner der Plugin heißt. Der sollte eigentlich leer sein. Nun hast du aber deine gedownloadeten Plugin's auf den Desktop. Das sollten .jar Dateien sein. Die ziehst du einfach in den Plugin Ordner und restartest den Server. Befehle für die Plugins stehen immer in den Thread drine. Als kleinen Tipp bzw. für Commands brauchst du unbedingt Essentials (

). Essentials brauchst du für Commands. Also ist es mit das wichtigste Plugin für deinen Bukkit Server.