Im schlimmsten falle geht es nicht mehr.
Hauptproblem ist der im allgemeinen noch komplizierte "Un"root der Geräte sprich das rooten ist ziemlich einfach aber die andere Richtung kann dich mitunter an deine IT-Technischen Grenzen führen, solltest du also evtl. mal wieder den Originalzustand haben wollen dann informiere dich zuerst darüber.
Solange du dich an die bewährten Tutorials hältst sollte mit deinem Handy nichts passieren und du kannst es einwandfrei (Bugs Fehler etc. der aufgespielten Firmware natürlich meist dabei) nutzen.
Grundsätzlich mehr als bei jedem iSchroot solltest du dir erstmal einige Tage Zeit nehmen und dich durch Foren die speziell dieses Thema behandeln lesen. Pro´s und Kontras, erfahrungsberichte, häufige fehler und deren behebung...