Windows 7 Benutzerdefiniert ohne formatieren installiert

Abend

ich habe mein PC mit Hilfe von CD neu installiert ( Windows 7 Ultimate) und konnte dabei die Festplatte nicht formatieren/löschen.
Dadurch ensteht wie gewöhnt Windows.old Ordner, die ich bereits mit Hilfe von Datenträgerbereinigung gelöscht habe
nur ist meine Frage wie sicher das ganze ist ? hatte vorher haufen Viren auf dem PC.

ich konnte nicht Booten und musste .exe manuell starten

Da der Virus noch drauf war kann er auch noch weiter Dateien infiziert haben, ergo ist das nicht sicher.