Bei mir hat er vorhin auch keine Pokestops mehr gefunden in Sydney. Hab ihn dann bisschen Ruhen lassen. Meine Pokemons auf dem Smartphone entwickelt und vor 5 min wieder gestartet. Läuft seither ohne Probleme.
Mir ist auch aufgefallen, dass jetzt die Liste "Do not transfer selected" richtig arbeitet, was mich anfangs gestört hat. Man kann jetzt auch in den Einstellungen einstellen, ob die Eier ausgebrütet werden sollen und welche Brutmaschinen verwendet werden sollen.
Probiert einfach mal das Programm neu starten. Wenn das nicht geht, dann ca. 30-45 min warten und dann erneut versuchen. Sollte dann wieder gehen.